检索、勾选,拿到下载码
筛选条件、文件类型一次选好,几百个编号可以批量粘贴。
基研数科为科研人员把 NCBI 变得好用:国内直接访问镜像,七个数据库统一检索,桌面客户端多路并行下载、逐个文件校验;本地网速不够,就交给网盘离线下载。
按物种、关键词检索,或者直接贴编号查询。结果表可以筛选、勾选、批量下载,常用的元数据一并列出。
网页上检索、勾选、生成下载码;之后用桌面客户端、命令行或者网盘离线下载,都凭这一个下载码取数据。按自己的网络和习惯选。
筛选条件、文件类型一次选好,几百个编号可以批量粘贴。
一个下载码,任意方式取数据
先测速选最快的线路;中断了用同一个下载码继续。
贴上编号就能提交,完成后用分享链接和提取码取文件,附带每个文件的 MD5。
在服务器或脚本里直接调用,适合批量任务和自动化。
和官网一样的页面、一样的功能,在国内也能顺畅浏览。选一个标着「推荐」的节点即可进入;桌面客户端里内置镜像,会自动挑选节点。
| Strain | Host | Isolation Source | Country/Region | Collection |
|---|---|---|---|---|
| BM407 | — | human case of meningitis | Viet Nam | 2004 |
| NCTC10234 | Pig | — | United Kingdom | 1961 |
| ISU2812 | Sus scrofa domesticus | respiratory tract | USA | 2012 |
| SS/UPM/MY/F001 | Felis catus | Oral cavity | Malaysia | 2020-08-19 |
| 2022WUSS148 | swine | brain tissue | China: JiangXi | 2022-04-06 |
| ID26102 | Sus scrofa domesticus | tonsil | Thailand | 2008-05 |
| CZ130302 | pig | — | China: Jiangsu | 2013-03-02 |
检索基因组时,宿主、分离来源、采集国家和时间直接列在结果表里,不用再一条条点进样本页面查;连同这些信息一起导出 CSV。
不用自己装 SRA Toolkit、也不用再转格式。客户端和网盘离线下载默认交付 FASTQ,双端数据自动分成 R1、R2;需要原始 .sra 文件,在设置里切换即可。
几个高频的小分析,在桌面客户端里就能完成,不必再另找软件、另配环境。
贴入一批蛋白编号,批量找回对应的 CDS 核酸序列,映射表可导出 CSV。
贴入核酸序列预测开放阅读框,按物种选择遗传密码表,细菌、噬菌体、病毒都适用。
上传 GenBank 注释文件,按基因名、产物或 locus_tag 找到基因,导出核酸或蛋白 FASTA。
用自己的 FASTA 序列建库并比对,基于 NCBI BLAST+,在本机完成,不上传服务器。
没有套餐,也不用预先购买容量。下面三条,就是全部的计费规则。
按实际下载的数据量结算;检索、建下载任务都不收费。
绑定公众号即可每月领取免费额度,扣费时先用额度,再用余额。
文件下完、校验通过才扣费;下载任务失败或取消不收费。